H Σοφία Μαρκαντωνάκη είναι απόφοιτος του τμήματος Φιλοσοφικών και Κοινωνικών Σπουδών της Φιλοσοφικής Σχολής του Πανεπιστημίου Κρήτης και του μεταπτυχιακού προγράμματος Επιστήμες της Αγωγής του ΕΑΠ. Από το 2000 έως σήμερα υπηρετεί στη δημόσια δευτεροβάθμια εκπαίδευση. Διετέλεσε για έξι χρόνια υπεύθυνη σε Γραφείο Σχολικού Επαγγελματικού Προσανατολισμού και τα τελευταία τρία χρόνια ως υποδιευθύντρια.