Ο Χαράλαμπος Μπουμπαγιατζόγλου σπούδασε στο Πάντειο Πανεπιστήμιο και απέκτησε τον διδακτορικό τίτλο του από το Τμήμα Διεθνών, Ευρωπαϊκών και Περιφερειακών Σπουδών του Παντείου το 2013. Τα γνωστικά ενδιαφέροντά του εστιάζουν στον εκδημοκρατισμό των πρώην κομμουνιστικών κρατών, στην ανάλυση εξωτερικής πολιτικής, στην πολιτική φιλοσοφία, στις θεωρίες εθνικισμού και απόσχισης και στην επίλυση διεθνοτικών συγκρούσεων, με έμφαση στην περιοχή των Βαλκανίων και την Ανατολική Ευρώπη. Από το 2013 έχει διδάξει στο Πάντειο Πανεπιστήμιο Θεωρία Εξωτερικής Πολιτικής, Ιστορία των Βαλκανικών Λαών, Συγκριτική Πολιτική, Μεθοδολογία των Πολιτικών Επιστημών και Αποσχιστικά Κινήματα. Έχει δημοσιεύσει άρθρα και έχει εισηγηθεί παρουσιάσεις σε επιστημονικά συνέδρια, πάνω σε θεματικές των γνωστικών ενδιαφερόντων του. Αυτή την περίοδο διδάσκει τα μαθήματα «Αποσχιστικά Κινήματα» και «Ευρωαμερικάνικες Σχέσεις» στο Τμήμα ΔΕΠΣ του Παντείου και βρίσκεται σε φάση συγγραφής του έργου του με αντικείμενο τους εθνικισμούς και τους εθνικούς μύθους στα σύγχρονα Βαλκάνια.