Το χειρόγραφο Βόινιχ περιγράφει την ιστορία ενός αινιγματικού βιβλίου που του έχει δοθεί ο τίτλος "το πιο μυστηριώδες χειρόγραφο στον κόσμο". Το ανακάλυψε σε ένα ιταλικό μοναστήρι ο Βίλφριντ Βόινιχ και έχει προκαλέσει την περιέργεια των ειδικών οι οποίοι το μελετούν χωρίς αποτέλεσμα εδώ και πολλά χρόνια. Γραμμένο σε μια περίεργη γραφή που μπορεί να κρύβει κάποια χαμένη ή μυστική γλώσσα, ή κάποιον κώδικα, περιέχει εκατοντάδες εικόνες άγνωστων φυτών, κοσμολογικά διαγράμματα, αλλά και ίσως αυτό που ξενίζει περισσότερο από όλα, τις παράξενες εικόνες γυμνών γυναικών μέσα σε ένα άγνωστο πράσινο υγρό...
Οι έρευνες συνδέουν το χειρόγραφο Βόινιχ με τη Βοημία του δεκάτου εβδόμου αιώνα και την Αυλή του Ρωμαίου Αυτοκράτορα Ροδόλφου του 2ου. Στη συνέχεια, μέσω του Ελισαβετιανού κατασκόπου και μάγου Τζον Ντι, τα ίχνη οδηγούν πίσω στην Αγγλία του Μεσαίωνα και στον πρώτο επιστήμονα που βασίστηκε στα πειράματα, τον Ρότζερ Μπέικον. Από τη νέα ανακάλυψη του το 1912, το χειρόγραφο έχει προκαλέσει την προσοχή μελετητών, επαγγελματιών κρυπταναλυτών, καθώς και ενθουσιωδών ερασιτεχνών από διάφορους χώρους, αρχίζοντας από τον Αμερικανό ακαδημαϊκό που η ενασχόληση του με το χειρόγραφο κατέστρεψε τη φήμη του, μέχρι κρυπταναλυτές του Δευτέρου Παγκοσμίου Πολέμου, που πάλεψαν επί είκοσι και πλέον χρόνια και ακόμα παλεύουν με τη λύση του αινίγματος της "Βοϊνιχικής" γλώσσας...